سلام.
شاید نتونی به صورت اصولی این پوشه های پیش فرض رو عوض کنی.. یه تک پوشه هم نیستن و کلی پوشن.. و اصن ساختار سیستم به هم می ریزه.. اگه خواستید در مورد Filesystem Hierarchy Standard بخونید برای اطلاعات بیش تر..:
https://en.wikipedia.org/wiki/Filesystem_Hierarchy_Standardاما یه کار جالب امکانش هست که انجام بدی..
اونم این که یه پوشه ی دلخواه مثلا usr/ رو انتقال بدی به یه پارتیشن جدا و هر بار بعد boot از اون پارتیشن mount بشه.. ینی قبل mount شدن محتویات پوشه ی usr/ خالی هست اما بعد mount شدن محتویات اون پارتیشن مربوط به usr/ می آد جاش..
این عملیات معمولا برای جدا کردن دایرکتوری home/ و در نظر گرفتن یه پارتیشن جدا براش انجام می شه..
ضمنا usr/ هم یه دایرکتوری برای مثال بود.. صرفا می خواستم بگم که می شه همچین کاری هم کرد.. فایل های نصبی برنامه ها در مسیرهای مختلفی داخل و خارج usr/ قرار می گیرن..
خوندن اون لینکی که دادم می تونه خیلی کمکتون کنه.. مثلا mnt/ چیه lib/ چیه bin/ چیه opt/ چیه..
در مورد این mount کردن و اینا هم اگه علاقه مند هستید می تونید مثلا این عبارت رو جست و جو کنید: mount /usr on new partition:
https://askubuntu.com/questions/656/how-to-move-usr-to-a-new-partitionhttps://askubuntu.com/questions/165659/mount-usr-on-new-partition...
اگه به مشکلی خوردید بگید ببینیم از کجاس..