مفهوم «کار درست» خیلی مفهوم دقیقی نیست. آره می شه از گیت استفاده کرد برای نگهداری تاریخچه / ورژن فایل هایت نظیمات. چه etc و چه دات فایل های داخل هوم هر یوزر (dot files, say .bashrc, .bitcoinو .. ). ممکن هم یکی اینها رو روی یک رپوزیتوری لوکال یا آنلاین مدیریت کنه. بازم بستگی به نیاز است.
اگر علاقمندی به دنبال dot file management سرچ کن و احتمالا به ایده های متنوع تری می رسی.