چمیدونم مثلا اجرای فایل jar توسط sh.
به هرحال انگار اینطوره
یه پرونده(فایل) با قالب(فرمت) .sh ایجاد کن، با nano هم میشه و محتوای زیر رو درش قرار بده، بجای filename.jar اسم پرونده .jar بنویس
#!/usr/bin/env bash
java -jar filename.jar
و اگه میگی در یه پوشه دیگه هست کافیه محل کامل اون رو بنویسی برای مثال اگه در Documents قرار داره پرونده احتمالا باید اینطوری بنویسی بجای filename.jar
/home/ali/Documents/filename.jar
خب بعدش دسترسی اجرایی به پرونده(فایل)ای که ساختی با قالب(فرمت).sh به این صورت chmod +x filename.sh
خب حالا با دستور ./run.sh
میتونی اجراش کنی و اگه مدیریت پرونده ات از بازکردن پرونده های .sh پشتیبانی کنه با دوبار کلیک باز میشه در غیر این صورت احتمالا باید از .desktop یا غیره استفاده کنی
ویرایش: بجای بعد home که نوشته شده باید نام کاربر خودت قرار بدی نه ali