با دیسک زنده اوبنوتو بوت کنید و بعد از منوی SYSTEM-> ADMINISTRATION گزینه PARTITION EDITOR رو باز کنید. از طریق این برنامه می تونید براحتی پارتیشن ها رو حذف کنید. این برنامه رابط گرافیکی برای برنامه ی PARTED هست.
پس از حذف پارتیشن ریشه / و همچنین SWAP و BOOT حتما بخاطر داشته باشید که پارتیشن ویندوز یا پارتیشنی که قصد دارید روی آن ویندوز نصب کنید را فعال ACTIVE کنید.