درود بر تو، به این انجمن خوش اومدی.
نیازی به این کارها نیست. اول از همه مطمئن شو که به اینترنت وصلی بعد، ترمینال (terminal) رو باز کن و سپس دستور زیر رو بزن:
$ sudo apt install gromacs libgromacs-dev gromacs-mpich
برای اینکه بخوای با c++ کد بزنی، دستور زیر رو هم بزن، تا مطمئن که کامپایلر سی++ نصب شده:
$ sudo apt install g++