شما برای چی رفتی engine و Gui رزو از سورس گرفتی کامپایل کردی؟
فقط دیتابیس مهمه اونا مهم نیستن.
مخازن اوبونتو معمولا نسخه قدیمی تری نسبت به آخرین نسخه داره ولی به شدت پیشنهاد میشه از اون استفاده کنید و خودتون کامپایل نکنید.
برای به روز رسانی database هم از دستور sudo freshclam استفاده کنید.
البته لازم به ذکره که این اسکریپت freshclam هر بار موقع خاموش شدن کامپیوتر فعال میشه و اگه به اینترنت وصل باشید خودش آپدیت ها رو میگیره.