این پروسهای که شما انجام دادین معادل دستور sudo apt-get autoclean هست و بسته هایی که دیگه قابل دانلود نیستند (از داخل مخازن حذف شدهاند) رو پاک می کنه. این دستور مشکل خاصی رو در اجرای برنامهها ایجاد نمی کنه (البته به شرط اینکه سیستم شما بهروز شده باشه).
کاری که جناب حسنپور فرمودند رو انجام بدین.