امکان لوگین با کاربر root وجود داره ( در انجمن جستجو کنید ! ) ولی به دلیل مسائل امنیتی اصلا توصیه نمیشه ! شما میتونید برنامه ی مورد نظرتون رو با دستورات sudo یا gksu از طریق ترمینال اجرا کنید. مثلا اجرای فایل منیجر nautilus با کاربر root از طریق ترمینال:
sudo nautilus