دلایلش زیاده.
۱. چون pip برای اجرا در محیط مجازی و بدون sudo طراحی شده
۲. چون غیر از home، تکتک پروندههای موجود در سیستمعامل باید به دست apt مدیریت شن.
۳. چون خیلی از پروندههایی که sudo (به درست) دستکاری میکنه،با پروندههای موجود در apt تداخل دارن.
۴. دستکاری اون پروندهها apt رو از کار میاندازه و توزیع رو خراب میکنه.
۵. pip به خاطر کاربردش، سامانهٔ ارتقا نداره و نصبش خارج از محیط مجازی موجب ناامن شدن سامانه میشه.
۶. و…