تا اونجایی که من میدونم apt یه front-end برای چند تا برنامه مثل apt-cache ، apt-get هست.
یعنی apt یه دستور سطح بالا تر نسبت به apt-get هست که کاربر بتونه راحت تر با سیستم ارتباط بر قرار کنه.
بهتره برای راحتی بیشتر از apt استفاده کنید، وگرنه در عمل دو تا دستور بالا تفاوتی با هم ندارن.
برای اطلاعات بیشتر دستور زیر رو تو ترمینال بزنید:
$ man apt