البته من الان از تاندربرد استفاده نمیکنم که بتونم دقیق بگم ولی فکر میکنم شما گزینه utf-8 رو از منوی View>Character Encoding انتخاب میکنید. که در این حالت utf-8 فقط برای صفحهای که در حال دیدن اون هستید اعمال میشه.
برای اینکه به صورت پیش فرض همهٔ ایمیلهای شما با کدپیج utf-8 نشون داده بشه در لینوکس باید از منوی Edit (یا Tools در ویندوز) گزینه Perefernces (یا Option در ویندوز) رو انتخاب کنید و بعد از برگهٔ Display>Fonts تنظیمات خودتون رو اعمال کنید.