ببینید روی سرور فرقی نداره از چه توزیعی استفاده کنید، مهم اون کانفیگ شما و مورد استفاده شما از سرور هست، دلیل عمده برای استفاده از CentOS نرم افزارهای مدیریت سرور مثل WHM، Kloxo و دیگر پنلها میباشد، در غیر این صورت فرق چندانی نمیکنه که از چه توزیعی بهره ببرید.
اوبونتو سرور هم همچون بقیه توزیعهای مختص سرور بوده و فرقی با اونها نداره.