دوست عزیز خیلی از برنامه ها برای اینکه ازشون استفاده کنی شکل گرافیکی ندارند و باید تو محیط دستوری اجراشون کنی و تو منو دیده نمیشن
و اگه مطمئن هستید که برنامه حالت گرافیکی داره یا نه و کلا برای مدیریت منوی خودتون تو ترمینال دستور
alacarte
رو وارد کنید یه پنجره باز میشه که میتونید به راحتی ازش استفاده کنید.
در مورد سوال alien هم mohi عرض کردند به ویکی مراجعه کنید جواب میگیرید حتما :
برای نصب بستههای سوزه که RPM هستند یک راهنمای خوب داریم: http://wiki.ubuntu.ir/RPM/AlienHowto
مثلا اگه ویکی رو بخونید بهتون میگه دستور :
alien -i package.rpm
بسته های سوزه رو به دبیان تبدیل میکنه