اگر تنظیمات پیشفرض رو تغییر نداده باشید این فایلها به مرور خودشون حذف میشن.
ولی اگر میخواهید دستی این کار رو انجام بدید اول با دستور زیر یه backup از فایلهایی که دانلود شده بردارید
sudo tar zcvf apt.tgz /etc/apt/ /var/lib/apt/ /var/cache/apt/
و اون فایل apt.tgz رو نگهدارید. برای تمیزکردن اون پوشه archives هم دستورات زیر رو استفاده کنید
sudo apt-get autoclean
sudo apt-get autoremove