در کوتاه مدت ممکنه پارت ntfs مشکلات کمی داشته باشه (البته نه از طرف لینوکس بلکه از طرف ویندوز)ولی در طولانی مدت با چک کردن اتوماتیک دیسک توسط چک دیسک ویندوز قسمت زیادی از اطلاعات رو ویندوز پاک میکنه علت این کار این هست که در نوع ذخیره فایل با فرمت لینوکس روی پارتتون ذخیره میشه و ویندوز (عمو بیلی ات دلش نمیخواد کسی لینوکسی بشه)قابلیت خوندن فایل ها با قالب بندی لینوکسی رو نداره و گند میزنه به داده هات
در هوم تمام اطلاعات کانفیگ برنامه ها و فیلم ها و عکس ها و دانلودهایی که از طریق لینوکس داری انجام میدی رو ذخیره میکنه (یه جورایی مهم هست که محفوظ باشه)پس بهتره که اون رو جدا بزاری و روی یک درایو با فرمت لینوکس باشه تا هنگام تعویض و تغییر توزیع و یا ... به مشکل برنخوری و همه پاک نشه
یه راه حل دیگه این که میتونی روی درایو لینوکیست اونها رو ذخیره کنی و با یک فایل منیجر خوب اونها رو از طریق ویندوز بیاری روی پارت ویندوزی (در این روش مشکل چک دیسک رو نداری)و برای همیشه هم از ویندوز و هم از لینوکس بهش دسترسی داشته باشی
http://forum.ubuntu.ir/index.php/topic,56092.0.html به این پست سری بزن
در ضمن این سوالات قبلا مطرح شده و بقول دوستان موتور های جستجوگر اینترنتی بهترین دوست یه کاربر لینوکسی هستن