فکر میکنم، با zero کردن کامل هارد مشکل رفع بشه.

این روش تمام اطلاعات شما رو حذف میکنه. حتما از اطلاعات بکاپ کامل تهیه کنید.
با یک توزیع لایو بالا بیاید.
با دستور
sudo fdisk -lاسم دیوایس هارد رو بدست بیارید. برای من
/dev/sdaهست. بعد این دستور رو بزنید:
dd if=/dev/zero of=/dev/sda bs=1Mاین عملیات چند ساعت طول میکشه. ولی هارد شما رو مثل روز اولش تمیز و خالی میکنه