MySQL خودش رابط گرافیکی نداره و شما برای استفاده از خودش به صورت پیشفرض باید از دستورات SQL استفاده کنید ولی خوب ابزارهای جانبی بسیار خوب و کاملی هستند که امکان استفاده از MySQL رو به صورت گرافیکی بهتون میدن... به نظرم phpmyadmin یکی از معروفترین و بهترین ابزارها باشه که وبی کار میکنه... تو مخازن اوبونتو هم هست.